A Magnesita foi criada em 1939, após a descoberta de depósitos de magnesita em Brumado, no estado da Bahia. Suas atividades industriais começaram em 1944, em Contagem (MG), com a produção de refratários aluminosos e sílico-aluminosos e, a partir de 1948, produzindo também magnesianos e cromo-magnesianos.

A partir de 1960, a Magnesita S.A. adquiriu e fundou empresas para a fabricação de insumos para lingotamento, fabricação de concretos refratários, produção de grãos eletrofundidos, entre outras. Essas empresas empregam a matéria-prima obtida em Brumado para a fabricação de refratários básicos, que utilizam também os produtos das usinas de sinterização. A década de 60 marcou ainda a abertura de capital da empresa, com a negociação de suas ações na Bovespa.

Na década de 90, foi inaugurado o terminal portuário em Aratu (BA), de onde a Magnesita exporta magnésio sintetizado. No mesmo período, o departamento comercial foi estruturado, com o intuito de atingir a indústria do cimento. Foi iniciado um novo modelo de negócios, focado particularmente no setor siderúrgico, tornando a Magnesita um fornecedor de soluções que atua bem próximo ao cliente, com produtos e serviços personalizados.

Em setembro de 2007, a Rpar Holding S/A adquiriu o controle da Magnesita S.A.. Por meio de um Acordo de Acionistas, firmado em fevereiro de 2008, foi aprovada uma reestruturação societária envolvendo a Rpar Holding S/A, a Partimag S/A e a Magnesita S.A.. A reestruturação teve o objetivo de promover o agrupamento das três empresas em uma única companhia aberta, com estrutura simplificada, alinhando e consolidando o interesse de todos os acionistas do Grupo. O novo desenho proporcionou a criação da Magnesita Refratários S.A. e sua listagem no Novo Mercado da Bolsa de Valores de São Paulo – Bovespa, em abril de 2008.

Em 25 de abril de 2008, a Magnesita celebrou contrato para a aquisição da totalidade das quotas representativas do capital social da Insider – Insumos Refratários para Siderurgia Ltda., empresa produtora de refratários monolíticos e pré-moldados de alta tecnologia e com sede na cidade de Coronel Fabriciano (MG). Em novembro de 2008, a Magnesita Refratários adquiriu a LWB Refractories, empresa alemã líder no mercado de refratários básicos e produtos dolomíticos de alto valor agregado. Com forte presença nos mercados europeu, norte-americano e asiático, a LWB mantém relacionamentos de longo prazo com os principais produtores de aço inoxidável e de aços longos, bem como outras siderúrgicas com aciarias elétricas e integradas.

A Companhia iniciou, em 2009, a exportação de soluções baseadas no modelo de aço vazado ou CPP (cost per performance). Trata-se de um modelo de negócio em que a remuneração está relacionada diretamente à performance do cliente e não à prática usual do mercado, que paga pelo volume (em toneladas) de refratários vendidos.